Densitatea minerală osoasă (DMO) scăzută este frecvent identificată la indivizii cu boală celiacă (BC) netratată, posibil din cauza malabsorbţiei calciului şi vitaminei D, eliberării citokinelor pro-inflamatoare, şi remodelării dezechilibrate a oaselor. O dietă fără gluten favorizează o creştere rapidă a DMO, ce conduce către o recuperare completă a mineralizării osoase la copii. Copiii pot atinge masa osoasă maximă dacă diagnosticul este pus, iar tratamentul administrat înainte de pubertate, în acest fel prevenind osteoporoza în perioada următoare a vieţii. O dietă fără gluten îmbunătăţeşte, dar rareori normalizează DMO la pacienţiii diagnosticaţi cu BC la maturitate.